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植物染色体荧光原位杂交测定染色体荧光原 [复制链接]

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原理-植物染色体荧光原位杂交测定-染色体荧光原位杂交测定

首先,染色体中的目的基因与带有地高辛或生物素标记的互补序列DNA或RNA探针杂交形成较稳定的杂交复合物。接着探针上的地高辛再与连接荧光素的抗地高辛抗体,或生物素再与连接荧光素的抗生物素抗体进行抗原-抗体反应结合。由于标记的荧光素在荧光显微镜下经过不同波长的激发光激发,可发射出不同颜色的荧光,因此,通过荧光素发射出的荧光可检测出目的基因在染色体中的分布位置。图1为地高辛-抗地高辛系统检测原位杂交示意图。

仪器设备

试剂-植物染色体荧光原位杂交测定-染色体荧光原位杂交测定

1.3XPBS(磷酸缓冲液):mmolL-1NaCl、30mmolL-1Na2HPO4和mmolL-1NaCl、30mmolL-1Na2HPO4,按1:1混合得到3XPBS,pH7.0,用蒸馏水稀释成1XPBS。

2.20XSSC(standardsalinecitrate):NaClg,柠檬酸三钠88g,用双蒸水溶解,1molL-1HCI调节pH为7.0,双蒸水定容至mL。其他各级SSC可由贮存液加双蒸水稀释获得。

3.卡诺固定液:95%乙醇:冰醋酸=3:1。4.各级乙醇,45%乙酸,1%醋酸洋红。

4.各级乙醇,45%乙酸,1%醋酸洋红。

5.70%甲酰胺/2XSSC:35mL甲酰胺,5mL20XSSC,10mL水。

6.50%硫酸葡聚糖(DS):65℃水浴中融化,4℃或一20℃保存。

7.杂交液:%甲酰胺20μL,50%DS8μL,20XSSC4μL,探针4μL(加前℃加热标记的探针2min,立即放在冰上冷却,使探针变性),封阻DNA50倍于探针DNA,10%SDS2μL,去离子水定容至40μL。

8.PI(propidiumiodide)/antifade溶液

PI原液:先以双蒸水配置溶液,浓度为μgmL-1,取出1mL,加39mL双蒸水,使终浓度为2.5μgmL-1。

antifade原液:以PBS缓冲液配制该溶液,使其浓度为10mgmL-1,用0.5mmolmL-1的NaHCO3调pH为8.0。取上述溶液1mL,加9mL甘油,混匀。

PI/antifade溶液I与antifade原液按体积比1:9比例充分混匀,一20℃保存备用。

9.生物素或地高辛荧光检测试剂盒。

10.TE(Tris/EDTA)液:10mmolL-1Tris-HC1,1mmolL-1EDTA,pH8.0。

材料

洋葱、蚕豆、大麦、小麦、大豆根尖。

方法步骤-植物染色体荧光原位杂交测定-染色体荧光原位杂交测定

1.中期染色体压片的制备

(1)取样:用刀片切下根尖,置于冰水共存的冰瓶中0~3℃处理24h。目的是获得较多中期分裂相的细胞。

(2)固定:经预处理的材料冲洗干净后,用卡诺氏固定液20℃固定20h,如果材料不立即进行压片,可置于70%乙醇溶液中待用。

(3)染色:将固定后的材料放人盛有1%醋酸洋红染色液中染色2~4h。

(4)分散与压片:将染色后的根尖放在干净的载玻片上,去掉根冠和伸长区部分,只留2~3mm长的分生区部分。加1滴45%乙酸,用镊子将根尖充分压碎,加盖盖玻片。在酒精灯,上微加热,稍冷却后,左手食指压紧盖片一个角,右手持解剖针,以针尖轻轻敲击盖片,使细胞均匀分散。然后,再换用解剖针的木柄端敲击盖片,使细胞压平。*后,在该片上垫一滤纸片,用拇指紧压使其更平。

(5)干燥压片:记下分散良好的中期细胞的坐标,并在盖玻片上标记位置后,将载玻片浸人液氮中速冻,再用解剖刀迅速掀掉盖玻片立即浸人95%乙醇中至少5s,空气中干燥。

2.探针的制备:按缺口平移DNA标记(Bio-11-dUTP或Dig-11-dUTP)试剂盒操作。

(1)取10μL模板DNA加入一新的离心管中,℃加热2min,立即转移到冰浴内冷却,g离心15min。

(2)倒掉上清液放在冰上,加入下列试剂/p>

10μLBio-11-dUTP或Dig-11-dUTP标记的混合dNTP;

5μLDNA聚合酶I;

5μL新稀释的DNaseI(取2μLDNaseI加μL重蒸水);

双蒸水加至50μL,短暂离心收集反应液在离心管的底部。

(3)置15。C水浴中2h。

(4)加5μLTE终止反应。

3.原位杂交

(1)染色体压片的变性:将染色体压片在60℃烘箱干燥1h后,用RNaseA37摄氏度处理1h,

2XSSC漂洗5min,70%去离子甲酰胺70℃变性2~3min,再分别在-20℃预冷的70%、80%、90%、%乙醇中各脱水5min,空气干燥。

(2)杂交:变性处理后的每张压片加40mL杂交液,覆盖盖玻片后置湿盒中,60℃温浴10min,37℃杂交过夜。

(3)漂洗:2XSSC室温10min,30%去离子甲酰胺37℃10min,2XSSC室温10min,1XSSC室温10min,PBS冲洗平衡。

(4)加稀释的兔抗生物素或地高辛抗体40μL,置湿盒中37℃浮育1h。

(5)PBS漂洗4次,每次10min。

(6)加荧光素(FITC)标记的羊抗兔免疫球蛋白溶液,置湿盒中37℃浮育1h。

(7)PBS漂洗4次,每次10min。

(8)用PI/antifade溶液染色2min。

(9)蒸馏水漂洗4次,每次10min。

(10)加盖盖玻片,用无荧光封片剂封片,荧光显微镜下观察。

注意事项

1.DNaseI的作用是在DNA双链上作用产生缺口,它的浓度和反应的时间长短与标记的探针的长度密切相关,通常以DNA片段长约~bp为宜。如片段较大,会使探针的渗透性降低,降低杂交率。这时应加适量DNaseI继续酶切,直至DNA片段长度合适后,加5μLTE终止反应;如果DNaseI的浓度太大或酶切时间过长会使合成的探针太短,容易产生非特异结合,造成本底增加。因此,*好用8.0gL-1琼脂糖/TBE缓冲液凝胶电泳检测标记探针的大小。

2.探针与目的DNA的特异性一定要强。

3.在制备中期染色体压片时,载玻片一定要清洗干净,否则染色体容易掉。

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